Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Chd1P40201 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chd1P40201 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Chd1P40201 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chd1P40201 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chd1P40201 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Chd1P40201 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms