Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Col18a1P39061 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col18a1P39061 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms