Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TtlP38585 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TtlP38585 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TtlP38585 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TtlP38585 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TtlP38585 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TtlP38585 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TtlP38585 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TtlP38585 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TtlP38585 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TtlP38585 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TtlP38585 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TtlP38585 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TtlP38585 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TtlP38585 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TtlP38585 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TtlP38585 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TtlP38585 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TtlP38585 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TtlP38585 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TtlP38585 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TtlP38585 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TtlP38585 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TtlP38585 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TtlP38585 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TtlP38585 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TtlP38585 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TtlP38585 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TtlP38585 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TtlP38585 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TtlP38585 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TtlP38585 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TtlP38585 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TtlP38585 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TtlP38585 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TtlP38585 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TtlP38585 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TtlP38585 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TtlP38585 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TtlP38585 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TtlP38585 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TtlP38585 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TtlP38585 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TtlP38585 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TtlP38585 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TtlP38585 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TtlP38585 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TtlP38585 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TtlP38585 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TtlP38585 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TtlP38585 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TtlP38585 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TtlP38585 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TtlP38585 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TtlP38585 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TtlP38585 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TtlP38585 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TtlP38585 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TtlP38585 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TtlP38585 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtlP38585 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtlP38585 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtlP38585 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtlP38585 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TtlP38585 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtlP38585 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtlP38585 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtlP38585 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtlP38585 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms