Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa1P35175 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa1P35175 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa1P35175 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa1P35175 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa1P35175 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa1P35175 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa1P35175 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa1P35175 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa1P35175 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa1P35175 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms