Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2aP34056 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2aP34056 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms