Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd3P30282 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms