Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msr1P30204 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msr1P30204 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msr1P30204 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msr1P30204 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Msr1P30204 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Msr1P30204 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Msr1P30204 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Msr1P30204 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Msr1P30204 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msr1P30204 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msr1P30204 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msr1P30204 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msr1P30204 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Msr1P30204 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msr1P30204 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msr1P30204 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msr1P30204 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msr1P30204 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msr1P30204 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msr1P30204 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msr1P30204 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msr1P30204 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msr1P30204 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms