Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif5cP28738 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif5cP28738 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif5cP28738 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif5cP28738 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif5cP28738 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif5cP28738 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif5cP28738 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif5cP28738 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms