Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col2a1P28481 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms