Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms