Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfraP26618 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms