Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb7P26011 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb7P26011 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms