Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PrkcaP20444 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms