Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rps6ka3P18654 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms