Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f1P17208 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou4f1P17208 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms