Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms