Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CnpP16330 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CnpP16330 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CnpP16330 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CnpP16330 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CnpP16330 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CnpP16330 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CnpP16330 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CnpP16330 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CnpP16330 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CnpP16330 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CnpP16330 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CnpP16330 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CnpP16330 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CnpP16330 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CnpP16330 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CnpP16330 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CnpP16330 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CnpP16330 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CnpP16330 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CnpP16330 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CnpP16330 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CnpP16330 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CnpP16330 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CnpP16330 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CnpP16330 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CnpP16330 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CnpP16330 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CnpP16330 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CnpP16330 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CnpP16330 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CnpP16330 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CnpP16330 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CnpP16330 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CnpP16330 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CnpP16330 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CnpP16330 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CnpP16330 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CnpP16330 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CnpP16330 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CnpP16330 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CnpP16330 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CnpP16330 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CnpP16330 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CnpP16330 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CnpP16330 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CnpP16330 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CnpP16330 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CnpP16330 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CnpP16330 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CnpP16330 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CnpP16330 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CnpP16330 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CnpP16330 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CnpP16330 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CnpP16330 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CnpP16330 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CnpP16330 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CnpP16330 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CnpP16330 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CnpP16330 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CnpP16330 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CnpP16330 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CnpP16330 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CnpP16330 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CnpP16330 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CnpP16330 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CnpP16330 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CnpP16330 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CnpP16330 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CnpP16330 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CnpP16330 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CnpP16330 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CnpP16330 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CnpP16330 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CnpP16330 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CnpP16330 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CnpP16330 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CnpP16330 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CnpP16330 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CnpP16330 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CnpP16330 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CnpP16330 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CnpP16330 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms