Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca3P16015 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ca3P16015 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca3P16015 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca3P16015 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca3P16015 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca3P16015 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca3P16015 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca3P16015 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca3P16015 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca3P16015 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca3P16015 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca3P16015 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca3P16015 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms