Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rag1P15919 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rag1P15919 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rag1P15919 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rag1P15919 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rag1P15919 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rag1P15919 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rag1P15919 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rag1P15919 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms