Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim30aP15533 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30aP15533 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms