Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf1P15314 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf1P15314 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms