Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd5P13379 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd5P13379 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd5P13379 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd5P13379 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd5P13379 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd5P13379 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd5P13379 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd5P13379 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd5P13379 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd5P13379 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd5P13379 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms