Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms