Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApcsP12246 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms