Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga5P11688 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga5P11688 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga5P11688 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga5P11688 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga5P11688 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga5P11688 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga5P11688 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga5P11688 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms