Protein–RNA interactions for Protein: P11033

Gzmd, Granzyme D, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmdP11033 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmdP11033 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmdP11033 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmdP11033 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GzmdP11033 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmdP11033 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmdP11033 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmdP11033 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmdP11033 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmdP11033 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms