Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms