Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc9P09633 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxc9P09633 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms