Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms