Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxb7P09024 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxb7P09024 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hoxb7P09024 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hoxb7P09024 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hoxb7P09024 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxb7P09024 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxb7P09024 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms