Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spta1P08032 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spta1P08032 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms