Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms