Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgamP05555 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms