Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04212 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04212 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04212 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04212 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04212 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P04212 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04212 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04212 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04212 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04212 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04212 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04212 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04212 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04212 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04212 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04212 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P04212 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P04212 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P04212 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P04212 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P04212 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04212 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04212 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04212 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04212 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04212 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04212 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04212 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04212 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04212 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04212 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04212 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P04212 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04212 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04212 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04212 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04212 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04212 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04212 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P04212 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P04212 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04212 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04212 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P04212 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04212 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P04212 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04212 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04212 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04212 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04212 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04212 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms