Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtnd1P03888 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtnd1P03888 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtnd1P03888 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtnd1P03888 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtnd1P03888 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms