Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01853 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01853 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01853 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01853 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01853 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01853 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01853 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01853 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01853 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01853 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01853 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01853 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01853 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01853 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01853 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01853 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01853 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01853 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01853 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01853 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01853 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01853 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01853 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01853 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01853 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01853 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01853 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01853 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01853 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01853 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01853 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01853 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01853 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01853 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01853 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01853 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01853 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01853 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01853 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01853 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01853 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01853 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01853 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01853 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01853 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01853 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01853 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01853 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01853 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01853 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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