Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01788 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01788 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01788 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01788 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01788 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01788 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01788 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01788 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01788 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01788 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01788 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01788 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01788 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01788 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01788 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01788 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01788 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01788 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01788 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01788 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01788 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01788 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01788 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01788 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01788 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01788 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01788 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01788 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01788 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01788 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01788 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01788 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01788 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01788 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01788 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01788 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01788 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01788 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01788 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01788 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01788 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01788 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01788 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01788 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01788 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01788 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01788 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01788 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01788 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01788 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01788 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01788 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01788 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01788 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01788 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01788 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01788 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01788 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01788 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01788 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01788 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01788 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01788 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01788 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01788 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01788 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01788 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01788 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01788 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms