Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4bP01029 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C4bP01029 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4bP01029 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4bP01029 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4bP01029 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C4bP01029 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4bP01029 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4bP01029 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C4bP01029 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4bP01029 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4bP01029 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4bP01029 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4bP01029 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C4bP01029 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4bP01029 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4bP01029 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4bP01029 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4bP01029 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4bP01029 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4bP01029 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4bP01029 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4bP01029 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4bP01029 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4bP01029 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4bP01029 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4bP01029 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4bP01029 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4bP01029 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C4bP01029 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4bP01029 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C4bP01029 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4bP01029 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4bP01029 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4bP01029 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4bP01029 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4bP01029 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4bP01029 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4bP01029 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4bP01029 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4bP01029 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4bP01029 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C4bP01029 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4bP01029 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4bP01029 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4bP01029 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4bP01029 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4bP01029 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4bP01029 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4bP01029 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4bP01029 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4bP01029 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4bP01029 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4bP01029 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4bP01029 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4bP01029 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4bP01029 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4bP01029 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C4bP01029 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4bP01029 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4bP01029 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4bP01029 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4bP01029 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4bP01029 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4bP01029 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4bP01029 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4bP01029 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4bP01029 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4bP01029 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4bP01029 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4bP01029 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4bP01029 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4bP01029 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4bP01029 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4bP01029 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4bP01029 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4bP01029 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
C4bP01029 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4bP01029 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4bP01029 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4bP01029 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4bP01029 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4bP01029 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4bP01029 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4bP01029 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4bP01029 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4bP01029 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4bP01029 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4bP01029 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4bP01029 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4bP01029 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4bP01029 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4bP01029 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4bP01029 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4bP01029 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4bP01029 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4bP01029 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4bP01029 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4bP01029 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4bP01029 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms