Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setdb1O88974 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setdb1O88974 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms