Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Serf1O88892 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serf1O88892 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms