Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacng2O88602 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms