Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops4O88544 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops4O88544 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops4O88544 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops4O88544 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops4O88544 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops4O88544 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms