Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AurkcO88445 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AurkcO88445 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AurkcO88445 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AurkcO88445 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AurkcO88445 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AurkcO88445 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms