Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Nid2O88322 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nid2O88322 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nid2O88322 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nid2O88322 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nid2O88322 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nid2O88322 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nid2O88322 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nid2O88322 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nid2O88322 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nid2O88322 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nid2O88322 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nid2O88322 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nid2O88322 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms