Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfnO70456 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfnO70456 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfnO70456 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfnO70456 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfnO70456 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfnO70456 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfnO70456 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfnO70456 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfnO70456 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfnO70456 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfnO70456 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfnO70456 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfnO70456 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfnO70456 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfnO70456 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfnO70456 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfnO70456 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfnO70456 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfnO70456 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SfnO70456 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SfnO70456 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfnO70456 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfnO70456 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SfnO70456 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfnO70456 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfnO70456 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfnO70456 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfnO70456 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfnO70456 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfnO70456 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfnO70456 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfnO70456 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfnO70456 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfnO70456 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfnO70456 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfnO70456 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfnO70456 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SfnO70456 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfnO70456 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfnO70456 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfnO70456 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfnO70456 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfnO70456 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SfnO70456 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SfnO70456 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SfnO70456 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SfnO70456 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SfnO70456 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SfnO70456 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SfnO70456 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SfnO70456 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SfnO70456 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SfnO70456 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SfnO70456 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SfnO70456 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SfnO70456 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SfnO70456 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SfnO70456 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SfnO70456 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SfnO70456 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SfnO70456 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SfnO70456 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SfnO70456 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SfnO70456 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SfnO70456 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SfnO70456 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SfnO70456 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SfnO70456 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SfnO70456 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SfnO70456 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SfnO70456 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SfnO70456 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SfnO70456 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SfnO70456 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SfnO70456 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SfnO70456 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SfnO70456 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SfnO70456 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SfnO70456 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SfnO70456 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SfnO70456 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SfnO70456 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SfnO70456 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SfnO70456 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SfnO70456 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SfnO70456 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SfnO70456 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SfnO70456 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SfnO70456 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SfnO70456 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SfnO70456 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SfnO70456 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SfnO70456 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SfnO70456 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SfnO70456 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SfnO70456 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SfnO70456 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SfnO70456 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SfnO70456 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms