Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp2a2O55143 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2a2O55143 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms