Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr2O55101 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms