Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngr1O55100 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr1O55100 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syngr1O55100 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syngr1O55100 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms