Protein–RNA interactions for Protein: O55057

Pde6d, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6dO55057 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6dO55057 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6dO55057 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms