Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pole2O54956 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pole2O54956 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pole2O54956 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms